巧克力囊肿9厘米，这种情况囊肿比较大，需要到医院根据情况积极治疗。巧克力囊肿多数是良性，一般不会出现恶变倾向。

巧克力囊肿主要是子宫内膜异位到卵巢，而形成卵巢巧克力囊肿，会出现痛经，并且呈逐渐加重趋势，会出现不排卵，影响生育情况，一般多数不会有癌变。所以，有巧克力囊肿的患者，建议尽早到医院去手术治疗，手术治疗后容易出现复发，必须到医院根据情况对症处理。

所以有巧克力囊肿的患者，都长到9公分了，这个时候建议尽早到医院通过手术的方式进行治疗，术后定期复查，术后用药防止复发就可以。术后尽早备孕，否则会影响生育。