经常起床腰疼可能是以下几种疾病所引起：

一、腰背肌筋膜炎。主要是由于腰背部着凉或者是长期劳累等因素所引起，在起床时就会出现明显的腰痛，在活动以后会逐渐地缓解，可通过热敷、按摩等方法予以改善。

二、腰肌劳损。通常为长期过度劳累或者是不良的坐姿所引起，会导致腰部两侧出现疼痛。可通过药物治疗与物理治疗予以缓解，在必要时还应对局部进行痛点封闭。

三、肾虚。如果男性长期饮酒吸烟或者是性生活过度，可能会引起肾虚，就可表现为腰酸腰痛、乏力、性功能障碍等。