中午醒来头疼的原因可能如下：

1.血压波动。有些人在睡觉和清醒的过渡时间会发生血压升高，从而导致高血压头疼。

2.紧张性头疼。有些人因为午睡时间短，所以没有很好地选择睡觉环境和姿势。从而导致了头颈部紧张性头疼。

3.脑供血不足。一般情况下，午睡都是在午饭不久之后，这时血液当中的血脂、血糖都比较高，造成血液黏稠度高；同时，大量血液充血到消化道中执行消化功能，使脑部含血量相对下降。这两个原因都导致脑部供血不足，从而引起午睡后头疼。

4.做梦的影响。

5.打鼾或者呼吸睡眠暂停综合征的影响。