确诊先天性巨结肠需结合临床表现、影像学检查、直肠肛门测压、组织病理学检查、直肠黏膜活检。具体分析如下：
1.临床表现：新生儿期出现胎便排出延迟、腹胀、呕吐等症状需高度警惕。婴幼儿期表现为顽固性便秘、营养不良、生长发育迟缓。部分病例伴有肠梗阻或小肠结肠炎，出现发热、血便等急症表现。病史采集需详细询问排便频率、粪便性状及伴随症状。
2.影像学检查：腹部X线平片可见肠管扩张及气液平面。钡剂灌肠造影是主要诊断手段，典型表现为狭窄段与扩张段之间的移行区，狭窄段肠管无正常蠕动。超声检查可辅助评估肠壁厚度及肠管扩张程度，但特异性较低。
3.直肠肛门测压：通过检测直肠肛门抑制反射判断肠道神经功能。先天性巨结肠患者因肠壁神经节细胞缺失，直肠扩张时肛门内括约肌无法松弛。该检查对短段型诊断价值较高，但新生儿可能出现假阴性结果。
4.组织病理学检查：手术切除标本的病理学检查是金标准。需观察肠壁肌间神经丛与黏膜下神经丛中神经节细胞是否缺如，同时确认无神经纤维增生。全层活检可提高准确性，但操作风险较大。
5.直肠黏膜活检：通过吸引活检或钳取活检获取黏膜及黏膜下层组织。乙酰胆碱酯酶染色阳性提示神经纤维异常增生，结合神经节细胞缺如可确诊。该方法创伤较小，但需多次取样避免漏诊。
诊断过程中需注意鉴别其他原因导致的便秘或肠梗阻，如甲状腺功能减退、肠神经元发育异常等。检查操作需严格遵循规范，避免并发症。治疗方案应根据年龄、病变范围及并发症情况个体化制定。
