夜间咳嗽得厉害的原因有很多，其中最常见的是反流性食管炎和过敏性咳嗽，也可能与慢性的呼吸系统疾病相关。

反流性食管炎是在身体平躺的情况下，胃酸反流至食道以及咽喉部位，对咽喉造成刺激而出现的咳嗽，站立后咳嗽症状会缓解。

过敏性咳嗽尤其在夜间容易发病，与接触冷空气或者致病原、致敏原有关，典型的特征是持续性的干咳。

对于患有慢性呼吸系统疾病的人群，也可能因为体位发生改变时痰液出现流动，从而对呼吸道黏膜造成刺激而引起的咳嗽、咳痰症状。