先天性的肛门失禁，可能是由于孕期接触有害化学物质或者放射性物质，导致的肌肉或者神经发育异常所致。

先天性的肛门失禁是指出生后即有肛门失禁，是由于孕期孕妇接触到影响胎儿发育的有害物理化学物质导致。最常见的是肛门局部发育不良，导致的肛门完全或者不全失禁，这种类型的失禁可以通过手术改善肛门的功能，部分轻症的患者甚至有可能会治愈。

当支配肛门的神经发育异常时，也可导致先天性肛门失禁，例如先天性脊柱裂患儿，这种类型的肛门失禁不能治愈，只能通过后期的一些治疗或者手术缓解症状。