食管结核主要与食管癌相鉴别。溃疡性的食管结核病变易被误诊误食管癌，食管病变引起的症状往往被其他器官的症状所掩盖，食管病变引起的食管狭窄出现进食吞咽困难又易于食管癌香混淆。鉴别要点主要是食管结核多发生于青壮年，年龄较轻，低于45岁，女性多见；而恶性肿瘤发病多在50岁以上，男性多见。食管结核病人多有肺结核病史或结核接触史，胸部X线检查提示肺部有陈旧性结核或有活动性结核病灶。 食管结核临床症状轻，吞咽困难呈非进行性吞咽困难，抗痨药物治疗有效；食管恶性肿瘤引起的吞咽困难及胸痛呈进行性加重，且一般情况恶化快。食管结核皮肤结核菌素试验(PPD皮试)阳性、血清结核抗体阳性。X线钡剂造影检查：食管结核食管腔有充盈缺损和溃疡，或黏膜呈虫蚀样改变。