肛瘘必须要治疗，肛瘘如果不治疗就会经久不愈周而复始，反复发作。肛瘘的发病原因是肛门直肠周围脓肿自行破溃或者手术切除切开引流后，形成通向体表的异常管道。

因为内口在肛管或者直肠，受到粪便的反复刺激，粪便残渣可以进入瘘管内，引起瘘管内压力增大。炎性肉芽增生，继发感染形成脓肿，脓液由外口排出后，局部肿痛可以减轻。在进入静止期时，临床症状轻微甚至无症状。

以后反复发作，因为瘘管周期性排出脓性渗液，可以引起肛周皮肤感染和肛周湿疹。瘘管可能发生癌变，所以建议患者尽早治疗。