睡觉起来引起肩膀疼痛，可能与以下原因有关：

1.颈椎病导致。如果本身存在着颈椎病，在睡觉时枕头枕的过高，或者受到一些受凉等因素的刺激，会引起颈部的神经根水肿，诱发颈椎病的发作，导致肩膀出现明显的疼痛。

2.睡觉姿势不正或者受凉引起。由于睡觉时长时间一种姿势或者没有盖好被子，咽部的软组织受到长时间的压迫，引起局部的肌肉的痉挛，血液循环不通畅，从而表现为局部的疼痛症状。

3.肩周炎或者肩关节劳损等引起。部分的中老年人由于本身肩关节出现了增生和退变，晚上睡觉由于寒冷的因素刺激，会导致局部的充血和水肿，引起肩关节疼痛、活动受限等表现。

出现疼痛以后要注意保暖，避免着凉，可以进行局部的热敷理疗，或者口服一些非甾体的止痛药进行针对性治疗，缓解局部的疼痛症状。