这可能与血清中的雌醇，一种女性激素浓度变化有关。

由于女性的生理特点，在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，引起颅内外血管及子宫血管对某些因素如5-羟色胺等物质更敏感，从而引起血管张力的变化，使一部分对此敏感的病人发生头痛。

月经后，血清中雌二醇浓度回复至正常，病人的头痛亦可缓解。还有妇女在月经期出现头痛，通常是偏头痛其中的一个类型，医学上叫做月经相关性偏头痛。偏头痛是原发性头痛，或者叫做功能性头痛当中最常见的一个类型。