只有跑步时腹痛，考虑是腹部受到震动，或是腹腔感染、肠梗阻等原因引起。

在跑步的时候因为腹部会出现震动，这时候会牵拉腹壁刺激腹腔内的神经，从而引起出现疼痛。一般休息过后疼痛可以缓解，这是生理性的因素。也可能是腹腔发生感染，由于炎症介质刺激腹腔的组织神经，再加上跑步的时候呼吸不畅，胸腔负压减少也可引起腹部疼痛。

发生肠梗阻的时候，由于跑步时血液会分配到身体各个部位，消化道暂时缺血从而引起胃肠平滑肌发生痉挛，可导致腹痛。