先天性肛门闭锁，原则上在确诊之后，建议及早地进行手术的治疗。

先天性肛门闭锁会出现胎粪的延迟排出，严重的还可能会导致患儿的水电解质的紊乱，所以要及时完善相关的检查，积极地通过内科进行辅助性治疗，避免发生水电解质的紊乱。

如果是低位的闭锁，一般可以进行一期的修复。如果是高位或者是中位的肛门闭锁，一般先进行临时性的造瘘手术，保证粪便的排出。再根据患者的具体情况，可以延续到3个月以后或者是再大一些进行手术的还纳，进行肛门的成形手术。一定要避免发生感染的情况，合理地使用抗生素药物。