两个眼睛大小不一样时，应结合患者具体病情来综合分析，主要有以下几种情况：

1.如果患者是先天性因素导致两只眼睛大小稍有异常，眼部功能正常，对日常生活无影响，可以考虑不予处理。

2.如果是上睑下垂导致两个眼睛大小不一致，将针对患眼给予眼部针灸、药物注射等保守治疗，必要时也可采取手术矫正，例如上睑提肌缩短、额肌瓣悬吊术等。

3.如果是先天性的眼裂狭窄、小眼球等病变，应采取睑裂开大的手术治疗，并注意排查全身性的相关遗传疾病。