先天性锁骨发育不全的鉴别诊断：

第一，软骨发育不全：会出现全身对称性的软骨发育障碍，患者会出现身材矮小、四肢短小。

第二，克丁病：显示颅骨发育迟滞，有缝间骨，但是无锁骨，坐骨缺损，患者明显会出现智力低下。

第三，成骨发育不全：会见有颅缝闭合延迟，但主要表现为容易骨折，骨痂形成旺盛，伴有不同程度的听力障碍等。

第四，佝偻病：佝偻病的主要特点，是会出现方颅、囟门闭合迟缓。

本病为先天性疾病，没有有效的预防措施，早诊断和治疗是本病的关键。