左脚大脚趾根部的疼痛可能有以下原因：

1.最常见的原因是痛风，在大多数患者中，痛风的第一个症状是大脚趾根部的疼痛，此时需要进行血尿酸检查以进行诊断，在严重的情况下，可能会形成痛风石。

2.由大脚趾底部的骨肿瘤或软组织的肿瘤引起的疼痛，应通过相关的体格检查和MRI诊断。

3.结核，骨结核和软组织结核出现在大脚趾的根部，此时可能还会出现疼痛，通常伴有皮肤发红、皮肤温度升高和全身症状，例如低烧、盗汗或食欲不振。

4.感染，如果存在软组织感染或骨骼感染，也可能发生大拇指根部疼痛，要进行相关的血液检查和核磁诊断。