脑干出血时瞳孔小可能是由于动眼神经受刺激、脑干功能受损、交感神经纤维受损、脑疝早期、药物作用等原因。具体分析如下：
1.动眼神经受刺激：脑干出血可能会刺激动眼神经，动眼神经中的副核发出的纤维支配瞳孔括约肌。当动眼神经受刺激时，会引起瞳孔括约肌收缩，从而导致瞳孔变小。这种情况下，随着出血情况的稳定，对动眼神经的刺激减轻，瞳孔可能会逐渐恢复正常。
2.脑干功能受损：脑干是人体的生命中枢，其中包含许多重要的神经核团和传导束。脑干出血会损害脑干的正常功能，影响到对瞳孔大小调节相关的神经传导通路。可能干扰正常的瞳孔调节机制，使瞳孔变小。治疗主要是针对脑干出血进行综合治疗，如控制血压、减轻脑水肿等，以改善脑干功能。
3.交感神经纤维受损：脑干中的交感神经纤维在瞳孔大小的调节中也起着重要作用。脑干出血若累及交感神经纤维，可导致交感神经对瞳孔的扩瞳作用减弱，而副交感神经相对占优势，使得瞳孔缩小。此时需要积极治疗脑干出血，促进受损神经功能的恢复。
4.脑疝早期：在脑疝早期，脑干受到压迫，可先出现瞳孔变小的表现。因为脑疝初期对脑干的压迫影响了瞳孔调节中枢及相关神经通路。随着脑疝的进展，瞳孔可能会逐渐散大。对于这种情况，需要紧急处理，如降低颅内压等措施，以防止脑疝进一步加重。
5.药物作用：如果患者正在使用某些药物，如阿片类药物等，这些药物可能会影响瞳孔大小，导致瞳孔变小。需要查看患者的用药史，评估药物对瞳孔的影响，必要时调整用药。
脑干出血是非常严重的疾病，在治疗过程中要密切观察瞳孔变化，因为瞳孔变化往往反映了病情的进展。同时，要积极控制原发病，如高血压等，以减少再次出血的风险。要注意保持患者呼吸道通畅，防止肺部感染等并发症的发生。
