三个月的宝宝有睡觉摇头的现象，要及时根据具体的病况和病因采取治疗，方法如下：

1.三个月宝宝睡觉摇头，可能是患上头部湿疹导致。此时要做好头皮的清洁，要遵医嘱使用药物涂抹在局部，涂抹湿疹膏后能使症状减轻。

2.在成长过程中缺乏钙质以及缺乏维生素D时，会引起此种症状。此时可以给孩子服用钙剂补充，或者母亲在哺乳期吃含钙丰富的食物，可以改善孩子缺钙的现象。

3.宝宝在受到惊吓时，也会出现睡觉总摇头和哭闹的表现。此时要及时安抚宝宝，在抚摸宝宝和拍打宝宝的背部后可以缓解症状。