高三学生头痛，可能是以下因素所导致：

1.如果在学习当中压力过大、精神过于紧张、经常熬夜，有可能会导致脑神经功能紊乱，会引起紧张性头痛。应当减轻心理压力、不要长期熬夜、保证充足睡眠，可能会逐渐改善。

2.如果存在偏头痛病史，没有做好日常护理，可能会导致偏头痛发作，就会引起头疼的症状。可能还伴有畏声、畏光等症状。

3.如果头痛症状持续加重，并且还存在恶心、呕吐等症状，应当警惕为脑肿瘤，需就医进行CT、磁共振等检测，明确诊断。