三个月的婴儿睡觉老是摇头的情况下，通常建议以下几种情况：

1.婴儿出现了缺乏温度低引起的佝偻病会出现明显的睡觉摇头，并伴有多汗、易惊、枕秃这些表现，所以要及时给婴儿补充钙和维生素D。

2.如果婴儿头皮出现了湿疹、瘙痒，造成了婴儿睡眠不舒服，也可以出现睡觉的时候老摇头。

3.如果婴儿睡觉老摇头，伴有哭闹的情况下，有可能是出现了中耳炎或者外耳道湿疹，造成了耳朵不舒服，婴儿睡觉的时候就会频繁摇头。

4.如果婴儿睡觉老是摇头，有可能是给婴儿的睡眠环境不好，捂得比较多，出汗比较多，造成了婴儿不舒服，就会频繁摇头。